實驗室凈化工程系統與傳統的潔凈室系統其實是大同小異的，只不過實驗室對潔凈室內的壓力、微生物控制及溫濕度控制相對較工業潔凈室要嚴格。常見的實驗室凈化工程裝修材料有夾心彩鋼板、鋼化玻璃、防火板等，潔凈實驗室必須按照《潔凈室施工與驗收標準》采用可以較好的密封并且不產塵的材料進行隔斷、吊頂裝修，潔凈實驗室通風系統一般采用組合式空調機組，其送風系統與各業潔凈室工程不同的地方是，不是所有實驗室都可以設置回風系統的，這需要根據用戶實驗室的用途以及實驗產品而定。類似于生物安全類實驗室就不可以做回風系統，或者說要以全排式潔凈室的做法來施工。