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海藻糖是一種典型應激代謝物，能夠在高溫、高寒、高滲透壓及干燥失水等惡劣環境條件下在細胞表面形成獨特的保護膜，有效地保護生物分子結構不被破壞，從而維持生命體的生命過程和生物特征。
海藻糖為體內有益腸道細菌--雙歧桿菌的增殖因子，可改善腸道微生態環境，加強胃腸道消化吸收功能，有效排除體內毒素，增強機體免疫抗病能力，研究還證明海藻糖具有較強的抗輻射作用。
海藻糖有3種光學異構體，分別是α，α-海藻糖（蘑菇糖，Mushroom Sugar）、α，β-海藻糖（新海藻糖，Neotrehalose）和β，β-海藻糖（異海藻糖，Isotrehalose）。其中只有α，α-海藻糖在自然界中以游離狀態存在，即為通常所說的海藻糖，廣泛存在于各種生物體中，包括細菌、酵母、真菌和藻類以及一些昆蟲、無脊椎動物和植物中，尤其在酵母中含量較多，面包和啤酒等發酵食品及蝦類等也含有海藻糖。α，β-型和β，β-型在自然界中很少見，僅在蜂蜜和蜂王漿中發現了少量的α，β-型海藻糖，α，β-型和β，β-型這兩種海藻糖可以化學合成。
海藻糖生產目的是為了獲得高純度海藻糖產品以及相關酶產品 。在實驗室和生產上制備海藻糖主要有三種方法：一是從生物細胞中提??；二是采用微生物發酵生產；三是采用微生物發酵提取相關海藻糖合成酶，采用酶法合成海藻糖。 [4]
發酵法：由于微生物生長旺、繁殖快，易于培養，采用深層發酵海藻糖具有先天的優越性，利用產海藻糖酵母、細菌等為出發菌株，選育出產海藻糖高產菌株，發酵生產海藻糖，再采用有效分離提取的方法提取和精制。 [4]
酶合成法：酶合成法是采用微生物發酵產生并提取相關海藻糖合成酶類，以各類碳水化合物為底物來合成海藻糖。酶的最大缺點是其脆弱性，容易失活，實際生產中使用相關合成酶進行海藻糖生產，要考慮保持酶活性和酶類制劑的成本，可使用酶固定化或細胞固定化技術來保護酶類。
