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影響硝化反應的環境因素溫度：影響硝化細菌的比增長速率，及活性。一般4~45℃，3℃。溶解氧：硝化細菌好氧菌，DO影響反應速率和細菌增長速度。一般DO2mg/L。堿度和pH：如反應式，硝化過程產生[H+]，消耗堿度，pH會下降。硝化細菌對pH相當敏感(亞硝酸菌pH=7.7~8.1活性強，硝酸菌pH=7.~7.8活性強)，pH不適宜時活性急劇下降，pH值波動是致命的。C/N比：硝化細菌比增速率很慢，比其它異養菌底一個數量級，污水中的C/N過高(COD/TKN=1~15)，對硝化細菌基質競爭不利。
