公司跨區遷移辦理流程如下：
1、申請人向擬遷入地的登記機關提交變更材料，擬遷入地的登記機關初審合格后出具企業遷移通知書；
2、企業將企業遷移通知書交到遷出地登記機關，遷出地登記機關將登記檔案采用掛號郵遞方式郵至遷入地登記機關；
3、企業到遷入地登記機關辦理變更登記，領取新的營業執照。公司變更登記事項涉及章程修改的，應提交修改后的公司章程或者公司章程的修正案一式兩份。
二、詳細分析
公司地址變更跨區，是指公司要跨區從事經營活動，需要在從事經營活動的縣區級注冊登記機關，申請公司地址變更登記。跨區辦理公司地址變更，需要由公司原注冊登記機關將公司檔案，遷移到跨區的注冊登記機關，再辦理公司地址變更登記。