在系統的總體結構設計上，充分考慮現狀以及未來的系統擴展需求，采用多接口、開放式框架設計；針對公交一卡通的實際情況，從可靠性、可管理性、可擴充性、開發性和安全性等角度出發，結合系統實現過程中可能會購買的各種系統，本系統采用客戶/服務器的體系結構。用以解決界面復雜、保密性、安全性高、以數據庫修改操作的需求。可以根據用戶要求定義數據庫。
       在進行應用程序的設計和開發時，采用站點與構件方式。不同的業務對應于不同的功能模塊。并且，每個操作人員和用戶在訪問某一個系統時，站點上僅出現其權限范圍內的應用和相關處理數據。通過系統的定制功能，可以提高系統的友好性和安全性。