1、微生物膜主要固著于填料的表面，微生物量比活性污泥法要高得多，因此對污水水質水量的變化引起的沖擊負荷適應能力較強。即使短時間中斷進水或工藝遭到破壞，反應器的性能也不會受到致命的影響，恢復起來較快，因此適應用于處理高濃度難降解的工業廢水。

2、反應器內的微生物量還可以高達活性污泥的5-20倍，因此處理能力大，一般也不用在建造污泥回流系統；生物膜含水率比活性污泥低，不會出現活性污泥法經常發生的污泥膨脹現象，能保證出水懸浮物含量低，因此運轉管理也比較方便。

3、生物膜中存在較高營養水平的原生物和后生動物，食物鏈較長，特別是生物膜較厚時，底部厭氧菌能降解好癢過程中合成的污泥，因而剩余污泥產量低，一般比活性污泥處理系統少1/4左右，可減少污泥處理與處置的費用。

MBR膜生物反應器可以截留濾除細菌、病毒等有害微生物，在降低消費費用的同時擴大了廢水回用的范圍。

MBR膜生物反應器的流程簡單，易于集成，處理系統占地僅為傳統工藝的二分之一。系統運行采用可編程控制器控制，可有效降低人工強度和運行費用。