微波殺菌是微波的熱效應和生物效應共同作用的結果。微波對細菌的熱效應是使蛋白質變性，使細菌失去營養、繁殖和生存的條件而死亡；生物效應是微波電場改變細胞膜斷面的電位分布，影響細胞周圍電子和離子濃度，從而改變細胞膜的通透性能，細菌因此營養不良，不能正常新陳代謝，細菌結構功能紊亂，生長發育受到抑制而死亡。此外，決定細菌正常生長和穩定遺傳繁殖的核酸（RNA）和脫氧核糖酸（DNA），是由若干氫鍵緊密連接而成的卷曲形大分子。足夠強的微波場可以導致氫鍵松馳、斷裂和重組，從而誘發遺傳基因突變，或染色體畸變，甚至斷裂
本設備可用于各種真空包裝的豆制品、麻辣食品、素雞、素肉、再生豆制品、豆粕、豆粉等的烘干或殺菌，設備從12kw-100kw都可定制，以該機為例殺菌量每小時100kg以上，相比蒸汽殺菌鍋可大大節省時間和能源，而且微波殺菌不需要高溫，完全不改變食品的成分和口味。