突破性新方法DeepSecMS助力深入解析硒蛋白質(zhì)組 為疾病機(jī)制研究開辟新路徑
中科院上海有機(jī)所團(tuán)隊(duì)在《Advanced Science》發(fā)表創(chuàng)新方法DeepSecMS，攻克硒蛋白質(zhì)組研究難題。該方法利用深度學(xué)習(xí)技術(shù)，基于硒代半胱氨酸（Sec）與半胱氨酸（Cys）的化學(xué)相似性，創(chuàng)新采用Cys數(shù)據(jù)代理訓(xùn)練策略構(gòu)建理論譜圖庫(kù)。
硒蛋白是一類含有稀有氨基酸硒代半胱氨酸(Sec)的特殊蛋白質(zhì)，在維持細(xì)胞氧化還原平衡、調(diào)控關(guān)鍵生理過(guò)程以及與神經(jīng)退行性疾病、癌癥、心血管疾病和糖尿病等多種重大疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。然而，受限于Sec的稀有性及檢測(cè)分析難度，人類迄今僅鑒定出25種硒蛋白，全面繪制硒蛋白圖譜并發(fā)現(xiàn)新成員仍是該領(lǐng)域面臨的重大挑戰(zhàn)。
中科院上海有機(jī)所團(tuán)隊(duì)在《Advanced Science》發(fā)表創(chuàng)新方法DeepSecMS，攻克硒蛋白質(zhì)組研究難題。該方法利用深度學(xué)習(xí)技術(shù)，基于硒代半胱氨酸（Sec）與半胱氨酸（Cys）的化學(xué)相似性，創(chuàng)新采用Cys數(shù)據(jù)代理訓(xùn)練策略構(gòu)建理論譜圖庫(kù)。
硒蛋白是一類含有稀有氨基酸硒代半胱氨酸(Sec)的特殊蛋白質(zhì)，在維持細(xì)胞氧化還原平衡、調(diào)控關(guān)鍵生理過(guò)程以及與神經(jīng)退行性疾病、癌癥、心血管疾病和糖尿病等多種重大疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。然而，受限于Sec的稀有性及檢測(cè)分析難度，人類迄今僅鑒定出25種硒蛋白，全面繪制硒蛋白圖譜并發(fā)現(xiàn)新成員仍是該領(lǐng)域面臨的重大挑戰(zhàn)。